一、水洗
（一）将内镜放入清洗槽内：
1、在流动水下彻底冲洗，用纱布反复擦洗镜身，同时将操作部清洗干净；
2、取下活检入口阀门、吸引器按钮和送气送水按钮，用清洁毛刷彻底刷洗活检孔道和导光软管的吸引器管道，刷洗时必须两头见刷头，并洗净刷头上的污物；
3、安装全管道灌流器、管道插塞、防水帽和吸引器，用吸引器反复抽吸活检孔道；
4、全管道灌流器接50毫升注射器，吸清水注入送气送水管道；
5、用吸引器吸干活检孔道的水分并擦干镜身。
（二）将取下的吸引器按钮、送水送气按钮和活检入口阀用清水冲洗干净并擦干。
（三）内镜附件如活检钳、细胞刷、切开刀、导丝、碎石器、网篮、造影导管、异物钳等使用后，先放入清水中，用小刷刷洗钳瓣内面和关节处，清洗后并擦干。
（四）清洗纱布应当采用一次性使用的方式，清洗刷应当一用一消毒。
二、酶洗
（一）多酶洗液的配置应按产品比例，浸泡消毒时间应不少于10分钟，结核感菌、其他分枝杆菌等特殊感染患者使用后的内镜浸泡不少于 45 分钟。
（二）将擦干后的内镜置于酶洗槽中，用注射器抽吸多酶洗液100毫升，冲洗送气送水管道，用吸引器将含酶洗液吸入活检孔道，操作部用多酶洗液擦拭。
（三）擦干后的附件、各类按钮和阀门用多酶洗液浸泡，附件还需在超声清洗器内清洗5～10分钟。
（四）多酶洗液应当每清洗1条内镜后更换。
三、清洗
（一）多酶洗液浸泡后的内镜，用水枪或者注射器彻底冲洗各管道，以去除管道内的多酶洗液及松脱的污物，同时冲洗内镜的外表面。
（二）用50毫升的注射器向各管道冲气，排出管道内的水分，以免稀释消毒剂。
各种附件的洗消要求（一）清洗槽、酶洗槽、冲洗槽经充分刷洗后，用有效氯含量为500mg/L的含氯消毒剂或者2000mg/L过氧乙酸擦拭。（消毒槽在更换消毒剂时必须彻底刷洗）。
（二）灭菌后的附件应当按无菌物品储存要求进行储存。
（三）每日诊疗工作结束，用75%的乙醇对消毒后的内镜各管道进行冲洗、干燥。
（四）内镜储柜内表面或者镜房墙壁内表面应光滑、无缝隙、便于清洁，每周清洁消毒一次。
（五）每日诊疗前再用2%戊二醛浸泡20分钟，冲洗干燥后方可给病人诊疗。