一、适于压力蒸汽灭菌的内镜或者内镜部件应当采用压力蒸汽灭菌，注意按内镜说明书要求选择温度和时间。
二、环氧乙烷灭菌方法适于各种内镜及附件的灭菌。
三、不能采用压力蒸汽灭菌的内镜及附件可以使用2%碱性戊二醛浸泡10小时灭菌。
四、达到消毒要求的硬式内镜，如喉镜、阴道镜等，可采用煮沸消毒20分钟的方法。
五、用消毒液进行消毒、灭菌时，有轴节的器械应当充分打开轴节，带管腔的器械腔内应充分注入消毒液。
六、采用其它消毒剂、消毒器械必须符合内镜清洗消毒技术操作规范规定（医疗机构使用的消毒剂、消毒器械或者其它消毒设备，必须符合《消毒管理办法》的规定），具体操作方法按使用说明。
七、过氧化氢低温等离子体灭菌器：低温低湿，灭菌时间短仅需45～60min，操作使用方便，效果可靠，不留残毒、不污染环境。对器材损伤小，适用于对不耐热器材的灭菌，可用于腹腔镜的消毒灭菌。采用化学消毒剂浸泡消毒的硬式内镜，消毒后应当用流动水冲洗干净，再用无菌纱布擦干。采用化学消毒剂浸泡灭菌的硬式内镜，灭菌后应当用无菌水彻底冲洗，再用无菌纱布擦干。灭菌后的内镜及附件应当按照无菌物品储存要求进行储存。